提速近10倍!基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》上。
全基因组选择作为新一代育种技术,通过构建预测模型,根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择,从而缩短育种世代间隔,加快育种进程,节约成本,推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心,极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型,难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型,非线性模型(如深度网络神经)具备分析复杂非加性效应的能力,人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机,深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料,通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比,该方法有以下优点: 可以利用多组学数据开展全基因组预测;算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构,可以有效降低模型错误率,提高运行速度;预测精度稳健,在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显;计算时间与传统方法相近,比已有深度学习方法提速近10倍;超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
12月全国白酒价格指数环比微涨,春节酒企促销力度或加大******
新京报讯(记者秦胜南)据四川省泸州市酒业发展促进局发布的2022年12月全国白酒价格指数走势分析显示,2022年12月全国白酒月环比价格指数100.13,上涨0.13%。该分析指出,当前除茅台之外各大名酒的去库存进程还未终结,春节期间酒企促销力度可能将加大。
2022年12月,全国名酒环比价格指数100.20,上涨0.20%。具体来看,泸州老窖上涨0.03%,郎酒上涨0.53%,五粮液上涨0.60%,剑南春上涨0.05%,品味舍得上涨0.81%,汾酒上涨0.47%,口子窖上涨3.22%,洋河酒上涨0.05%,今世缘酒上涨0.23%,黄鹤楼上涨0.34%,酒鬼酒上涨0.16%;价格下跌的名酒有:水井坊下跌0.02%,全兴酒下跌1.65%,绵竹酒下跌0.11%,茅台下跌0.02%,董酒下跌4.31%,习酒下跌0.02%,西凤酒下跌0.61%,稻花香下跌1.30%,宋河粮液下跌1.91%,宝丰酒下跌3.40%,四特酒下跌0.26%;其他名酒价格保持稳定。
分析指出,2022年三季度六家名酒上市公司营收在白酒行业占比超过83%,净利润在白酒行业占比超过91%,显示出行业集中度进一步提升的趋势。当前,除茅台之外各大名酒的去库存进程还未终结,原有的库存加上疫情以来造成的消费场景受限、消费力下滑,令名酒不敢贸然亮出涨价的招牌。分析认为,2023年春节很大可能是除了茅台等少数名酒“皇帝的女儿不愁嫁”,大多数名酒和地方酒可能仍将延续2022年9月中秋期间的降价促销策略,而且春节期间的促销力度可能将加大。
2022年12月,地方酒环比价格指数100.08,上涨0.08%。具体来看,宜宾青花叙府上涨0.24%;绵阳丰谷酒上涨2.31%;新疆伊力酒上涨0.95%;江西李渡酒上涨0.97%;山东景芝酒上涨0.47%;内蒙古河套酒上涨0.47%;北京牛栏山酒上涨1.34%。地方酒下跌的有:宜宾梦酒天之梦铜樽下跌7.09%;成都文君酒下跌0.85%;河北衡水老白干下跌0.15%;贵州金沙古酒下跌2.22%;北京红星酒下跌0.52%;河南杜康酒下跌0.89%;湖北白云边下跌0.03%;其他地方酒价格保持稳定。
上述分析认为,当前白酒步入挤压式增长阶段,市场份额逐步向中高端品牌集中,低端白酒步入阵痛期。地方白酒需要更好地提升内功、完善营销和服务以逐步促进品牌升级。
(文图:赵筱尘 巫邓炎)